Viitorul îndepărtat, anul 5012. Brusca invazie aeriană a Pământului de către extratereștri și creațiile lor, mașinăriile, a adus omenirea la un pas de extincție. Supraviețuitorii s-au refugiat pe Lună pentru a organiza un contraatac folosind drept soldați care să recucerească Pământul. Totuși, deoarece mașinăriile continuă să se multiplice la nesfârșit, războiul ajunge într-un impas. Drept răspuns, omenirea trimite un nou echipaj de războinici androizi drept armă supremă: YoRHa. Abia trimisă pe Pământ, 2B face echipă cu 9S, analistul staționat în prezent acolo, unde, în timpul misiunii lor, cei doi dau de o mulțime de fenomene misterioase… Aceasta este povestea acestor androizi lipsiți de viață și a luptei lor nesfârșite pentru omenire.